在朱由检的构想中，未来不管是理工学院还是其他类型的高等大学，都将会以超然的方式存在，朝廷相关衙门仅对其具有指导作用，而不是约束和管辖作用。
有事大家可以坐下来谈，相关衙门可以提出某方面的意见和建议，但在学术问题上，还是要大学自己说了算。
大学就是研究和讨论学术的地方，是一块净土，一旦被权势侵袭，那就会逐渐失去它最初的意义。
理工学院祭酒都将是礼部尚书级，将来其他大学也会依照此例，但级别可能不会这么高。
朱由检并没有打算让方以智从政。
大明不缺官员，但方以智这样的人才却是极其稀缺，如果让他从政，那大明最多就是多一个贤臣，却会失去一位能够培养大批人才的良师。
另一位名人朱舜水（朱之瑜）已经在崇祯十一年被朱由检安排进了理工学院，现在的职务是人文学院的山长，职级为正五品。
对于这位博采众长的实用主义人物，用他的思想来影响和改变举子们陈旧的观念，这才是最为关键的。
朱舜水曾经专门对实用主义做过简单的阐述。
“所谓实用者，一曰有益于自己身心，二曰有益于社会。”
“为学之道，在于近里着己，有益天下国家，不在掉弄虚脾，捕风捉影。……勿剽窃粉饰自号于人曰‘我儒者也’。处之危疑而弗能决，投之艰大而弗能胜，岂儒者哉？”
朱舜水这种先进的理念和思想，正是朱由检极为赏识的。
从厂卫暗探反馈的信息来看，在赴任人文学院这三年多来，朱舜水这种实用主义思想，正在被更多的举子所接受，而随着笛卡尔等人的到来，更是为实用主义的推广提供了一个极佳的平台。
朱由检有理由相信，只要理工学院能够创造出更多新事物，在这种示范效应下，务实作风将会在更加广泛的范围内得以推广，理工学院将会成为改变大明的人才摇篮。
但是，要想彻底打破千百年来的某些腐朽思想的禁锢，舆论的引导将会是极为重要的。
引导舆论的大杀器------报纸是不是该登场了？
如果把朱舜水、方以智等人的观点刊登与上，进行大面积大范围的传播，在辅以具体的事例，比如各地开荒拓田取得的成效、下乡举子中表现优异的一些正面典型、理工学院学以致用诞生的最新成果等等，那对整个社会的潜在影响将会是十分巨大的。
舆论的作用是无与伦比的，来自后世的朱由检自然是最清楚不过。
但这种足以改变整个世界的武器也是柄双刃剑，一旦控制不好，未来会对社会造成非常严重的危害，说它是洪水猛兽也丝毫不为过。
现在大明办报纸的技术条件已经具备，无论是油墨、活字印刷书、纸张，甚至是套图等各项技术已是非常成熟，只要自己把这个创意一讲，朱由检相信，不出数日，一份样本便会摆在自己的面前。
现在的将作局汇聚了各行业的能工巧匠，再加上四海商行招揽的各种人才，京师的技术力量已经远超经济繁荣的江南地区，等到数年后理工学院的首批人才成长起来，各种新生事物就会以雨后春笋之势茁壮成长，成为大明经济社会发展的强劲动力。
至于谁来掌管这个治世利器，朱由检的心里的人选倒是有几个。
朱舜水、陈子龙、吴伟业、张岱。
这四人都是明末的大才子，每个人的名气在后世都是响当当的，而支撑名气的就是他们本身具备的超凡才华。
朱舜水就不必再提，先说陈子龙。
被后世誉为“明诗殿军”、“明代第一词人”的陈子龙可以说是上述四人中文学成就最高的。
其特出之才情、文章，与铮铮之民族气节，毫无争议的成为明末清初文坛盟主，《明史》中也有他的本传，称其“生有异才，工举子业，兼治诗赋古文，取法魏、晋，骈体尤精妙”。
其诗歌创作，尤其是中后期诗歌创作，旨在继承盛唐诗歌创作反映现实的精神，特别强调文学创作的社会意义，所以其诗感慨时事，关心民生，雄深豪迈，沉郁顿挫，苍劲之色与节义相符，同时文辞华美、音韵铿锵，浸透着忧国忧民的真挚情怀与高尚的爱国节操，是结束明代复古派诗歌创作的最后一个大诗人。
而这位大名士在历史上的结局也是十分地悲壮。
在抗清被俘押往南京的途中，途经松江境内跨塘桥时，他乘守者不备，突然投水以死，捞起时已经气绝，清军还残暴地将其凌迟斩首，弃尸水中。时年四十岁。
今年三十四岁的陈子龙正处在人生最好的年华，虽然还没有经历前世历史中那些坎坷，但其才华依旧是冠绝群伦。
崇祯十一年时，在朱由检的授意下，陈子龙在观政结束后，被吏部派往南京府为官，从锦衣卫呈送的奏报来看，这几年陈子龙在本职中还是表现的较为出色，从其处置的几件案子中可以看出，陈子龙刚正不阿的作风一如历史上那般，并没有因为环境太过平顺而失去自我。
其实朱由检把陈子龙打发到南京府，并不是想看看这位名士的治政能力，他的初心是打算看看，在历史已经彻底改变之后，陈子龙和柳如是能不能走到一起。
崇祯八年两人短暂同居过，彼此之间的感情还是相当深挚的，这一点从《柳如是别传》里还是能够得出确凿证据的，但令人遗憾的是，两人终不得谐连理。
这其中的原因有几个方面。
一是由于陈妻张孺人不能相容，柳亦不愿为妾。
二是由于陈当时经济状况不能满足柳之要求。
要知道作为秦淮河的培育出来的柳如是，过惯了纸醉金迷的生活，从原先那种千人宠万人哄的状态，骤然过起了清贫的日子，巨大的心理落差下，柳如是虽然与众不同，但一时半会还是很难接受的。
这种事其实在后世屡见不鲜。
许多山盟海誓，最终还是败给了柴米油盐。
朱由检认为，除了上述原因外，还有更深层次、更为关键的因素，导致两人最终分道扬镳。