两人道谢过后，转身离开了宝可梦中心，按照指引朝着若叶镇郊外走去。皮卡丘紧跟在两人身侧，时不时蹦跳着观察四周，对这片陌生的土地充满新鲜感。
走出若叶镇的镇区范围，眼前的景象骤然变得开阔起来。大片平整的浅滩草地延伸向远方，青草长势茂盛，柔软的草叶被风吹得轻轻起伏，如同绿色的波浪。草地边缘连接着一片浅浅的水域，溪水清澈见底，水底的鹅卵石清晰可见，几只野生的乌波、灯笼鱼在水中悠闲游动，见到生人也只是慢悠悠地游开。空气中混合着青草、溪水与泥土的气息，清新又怡人。
一路前行，没过多久，一座气派的白色独栋建筑便出现在视野当中。建筑占地面积很大，主体为纯白色，搭配浅灰色的窗框与屋檐，四周围着低矮的白色围栏，围栏内开辟出大片培育场地，划分成不同的区域，显然是用来饲养、培育各类宝可梦的场地。建筑顶端立着一块木质牌匾，上面写着空木宝可梦研究所几个大字，这里便是此行的目的地。
还未走到研究所门口，两人就察觉到气氛有些不对劲。原本应该充满欢声笑语、宝可梦叫声此起彼伏的研究所，此刻格外安静，甚至隐隐能听到屋内传来焦急的交谈声。围栏外站着几位附近的居民，脸上都带着担忧的神情，交头接耳地议论着什么。
“看来事情确实不简单。” 林孝低声说道，脚步加快，带着小智推开围栏的小门，径直走向研究所的正门。
走到门口，还没抬手敲门，大门便从里面被拉开。一位身着白色研究大褂、头发花白却精神饱满的中年男子走了出来，他眉头紧锁，脸色凝重，眼神里满是焦急与不安，想必就是这座研究所的主人 —— 空木博士。在他身后，正是之前宝可梦中心那位负责登录业务的乔伊小姐，此刻她也面露愁容，身旁的吉利蛋局促地搓着双手。
空木博士看到门外的小智和林孝，先是微微一怔，随即勉强压下心头的焦躁，开口问道：“两位年轻人，请问你们来到研究所是有什么事吗？现在我们这里出了意外，恐怕暂时没办法接待访客。”
“空木博士您好！” 小智主动上前打招呼，“我们本来是来办理城都联盟登录的，乔伊小姐说您这边出了状况，所以我们特意过来看看，要是有什么我们能帮忙的地方，请尽管吩咐！”
听闻两人是前来帮忙，空木博士眼中闪过一丝意外，随即像是抓住了救命稻草一般，长长叹了一口气，语气沉重地讲述起事情的来龙去脉：“唉，真是屋漏偏逢连夜雨啊。事情是这样的，我们研究所一直负责培育城都地区的三只初始宝可梦：菊草叶、火球鼠和小锯鳄。每天都会有本地的新人训练家前来领取属于自己的第一只宝可梦，开启冒险之旅。”
他顿了顿，抬手揉了揉发胀的太阳穴，继续说道：“今天上午清点培育区的宝可梦时，我们发现，专门留给新人训练家的一只小锯鳄不见了！整个研究所里外都仔细搜查了一遍，培育室、饲养区、活动场地、储物间，所有角落都找遍了，完全不见它的踪影。监控录像被人为破坏，围栏也有一处被撬开的痕迹，很明显，是有人故意潜入研究所，偷走了这只小锯鳄！”
“偷走了？” 小智瞪大了眼睛，满脸惊愕，“居然有人偷宝可梦？太过分了吧！” 在他的认知里，宝可梦是训练家最珍贵的伙伴，用偷窃的方式夺走别人的宝可梦，是极其卑劣的行为。
“没错。” 一旁的乔伊小姐补充道，语气也带着愤慨，“空木博士培育的这只小锯鳄性格温顺，天赋也很不错，原本是准备交给今天前来报到的新人训练家的。现在宝可梦失窃，新人训练家失望而归，博士也急得团团转，我接到消息后就立刻赶过来帮忙了。”
“有没有看到可疑的人？或者发现什么线索？” 林孝冷静地询问，条理清晰地梳理情况。他知道当务之急是找到窃贼，追回被偷走的小锯鳄。
空木博士摇了摇头，脸色愈发难看：“事发突然，清晨守卫换班的间隙，对方趁机潜入，动作十分利落，没有留下明显的外貌线索。只在被撬开的围栏边上，发现了几片不属于本地的黑色布料碎屑，还有一些奇怪的黑色烟雾残留。而且对方行动速度极快，得手之后立刻撤离，我们发现失窃时，人早就跑远了。”
“黑色布料、黑色烟雾……” 小智皱起眉头，脑海里瞬间闪过一些不好的猜测，“该不会又是那些专门抢夺、偷窃宝可梦的不法组织吧？我在关都地区旅行的时候，就遇到过不少这样的坏人，总是想方设法抢夺别人的宝可梦。”
“很有这个可能。” 空木博士沉声道，“城都地区近期也陆续出现过几起小型宝可梦失窃案件，作案手法十分相似，看来是同一伙人所为。这只小锯鳄还年幼，独自在外十分危险，若是落到不法分子手中，后果不堪设想。我已经安排研究所的工作人员分方向外出搜寻，可到现在为止，依旧没有任何消息。”
看着空木博士焦急的模样，还有乔伊小姐担忧的神情，小智立刻握紧拳头，一脸认真地说道：“博士，请放心！我们也加入搜寻队伍！我和皮卡丘一定会尽全力把小锯鳄找回来，抓住那些偷宝可梦的坏人！”
皮卡丘立刻配合地挺起胸膛，发出一声坚定的 “皮卡！”，小小的身体里充满了干劲。
林孝也附和道：“我们对周边地形还算适应，多两个人搜寻，范围也能扩大一些。请告诉我们大致的撤离方向，我们立刻出发。”